Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM23P36406 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms