Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpoP35419 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TpoP35419 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpoP35419 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpoP35419 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpoP35419 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpoP35419 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpoP35419 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpoP35419 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpoP35419 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpoP35419 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpoP35419 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpoP35419 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TpoP35419 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TpoP35419 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TpoP35419 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TpoP35419 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TpoP35419 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TpoP35419 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TpoP35419 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TpoP35419 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TpoP35419 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TpoP35419 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TpoP35419 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TpoP35419 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TpoP35419 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TpoP35419 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TpoP35419 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TpoP35419 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TpoP35419 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TpoP35419 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TpoP35419 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TpoP35419 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TpoP35419 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TpoP35419 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TpoP35419 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TpoP35419 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TpoP35419 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TpoP35419 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TpoP35419 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TpoP35419 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TpoP35419 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TpoP35419 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TpoP35419 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TpoP35419 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TpoP35419 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TpoP35419 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TpoP35419 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TpoP35419 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TpoP35419 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TpoP35419 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TpoP35419 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TpoP35419 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TpoP35419 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TpoP35419 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TpoP35419 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TpoP35419 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TpoP35419 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TpoP35419 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TpoP35419 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TpoP35419 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TpoP35419 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TpoP35419 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TpoP35419 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TpoP35419 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TpoP35419 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TpoP35419 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TpoP35419 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TpoP35419 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TpoP35419 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TpoP35419 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TpoP35419 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TpoP35419 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TpoP35419 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TpoP35419 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TpoP35419 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TpoP35419 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TpoP35419 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TpoP35419 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TpoP35419 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TpoP35419 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TpoP35419 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TpoP35419 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TpoP35419 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TpoP35419 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TpoP35419 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TpoP35419 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TpoP35419 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TpoP35419 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TpoP35419 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TpoP35419 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TpoP35419 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TpoP35419 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TpoP35419 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TpoP35419 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TpoP35419 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TpoP35419 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TpoP35419 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TpoP35419 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TpoP35419 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms