Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab20P35295 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab20P35295 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab20P35295 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab20P35295 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab20P35295 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab20P35295 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms