Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab21P35282 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab21P35282 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab21P35282 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab21P35282 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab21P35282 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab21P35282 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms