Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms