Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp4P35123 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp4P35123 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp4P35123 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp4P35123 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp4P35123 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp4P35123 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms