Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms