Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msr1P30204 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msr1P30204 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msr1P30204 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Msr1P30204 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msr1P30204 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msr1P30204 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms