Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Casp1P29452 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Casp1P29452 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Casp1P29452 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Casp1P29452 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casp1P29452 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Casp1P29452 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Casp1P29452 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Casp1P29452 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Casp1P29452 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Casp1P29452 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Casp1P29452 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms