Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms