Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa5P28312 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Defa5P28312 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Defa5P28312 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms