Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa3P28310 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa3P28310 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa3P28310 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa3P28310 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa3P28310 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms