Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms