Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms