Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BrafP28028 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BrafP28028 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BrafP28028 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BrafP28028 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BrafP28028 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BrafP28028 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BrafP28028 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BrafP28028 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BrafP28028 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BrafP28028 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BrafP28028 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BrafP28028 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BrafP28028 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BrafP28028 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BrafP28028 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BrafP28028 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BrafP28028 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BrafP28028 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BrafP28028 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BrafP28028 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BrafP28028 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BrafP28028 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BrafP28028 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BrafP28028 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BrafP28028 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BrafP28028 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BrafP28028 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BrafP28028 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BrafP28028 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BrafP28028 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BrafP28028 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BrafP28028 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BrafP28028 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BrafP28028 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BrafP28028 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BrafP28028 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BrafP28028 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BrafP28028 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BrafP28028 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BrafP28028 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BrafP28028 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BrafP28028 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BrafP28028 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BrafP28028 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BrafP28028 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BrafP28028 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BrafP28028 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BrafP28028 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BrafP28028 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BrafP28028 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BrafP28028 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BrafP28028 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BrafP28028 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BrafP28028 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BrafP28028 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BrafP28028 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BrafP28028 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BrafP28028 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BrafP28028 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BrafP28028 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BrafP28028 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BrafP28028 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BrafP28028 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BrafP28028 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BrafP28028 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BrafP28028 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BrafP28028 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BrafP28028 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BrafP28028 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BrafP28028 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BrafP28028 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BrafP28028 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BrafP28028 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BrafP28028 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BrafP28028 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BrafP28028 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BrafP28028 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BrafP28028 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BrafP28028 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BrafP28028 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BrafP28028 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BrafP28028 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BrafP28028 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BrafP28028 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BrafP28028 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BrafP28028 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BrafP28028 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BrafP28028 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BrafP28028 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BrafP28028 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BrafP28028 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BrafP28028 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BrafP28028 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BrafP28028 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BrafP28028 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BrafP28028 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BrafP28028 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BrafP28028 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BrafP28028 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms