Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpbP27790 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpbP27790 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CenpbP27790 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CenpbP27790 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpbP27790 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpbP27790 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms