Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ggta1P23336 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ggta1P23336 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ggta1P23336 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ggta1P23336 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ggta1P23336 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms