Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Fcer1aP20489 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Fcer1aP20489 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Fcer1aP20489 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Fcer1aP20489 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Fcer1aP20489 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Fcer1aP20489 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Fcer1aP20489 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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