Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms