Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms