Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rps6ka3P18654 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms