Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms