Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfb3P17125 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms