Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calb1P12658 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calb1P12658 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calb1P12658 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calb1P12658 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calb1P12658 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calb1P12658 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms