Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SparcP07214 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SparcP07214 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SparcP07214 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SparcP07214 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SparcP07214 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SparcP07214 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SparcP07214 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SparcP07214 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SparcP07214 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SparcP07214 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SparcP07214 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SparcP07214 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SparcP07214 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SparcP07214 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SparcP07214 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SparcP07214 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SparcP07214 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SparcP07214 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SparcP07214 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SparcP07214 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SparcP07214 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SparcP07214 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SparcP07214 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SparcP07214 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SparcP07214 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SparcP07214 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SparcP07214 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SparcP07214 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SparcP07214 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SparcP07214 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SparcP07214 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SparcP07214 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SparcP07214 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SparcP07214 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SparcP07214 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SparcP07214 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SparcP07214 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SparcP07214 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SparcP07214 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SparcP07214 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SparcP07214 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SparcP07214 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SparcP07214 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SparcP07214 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SparcP07214 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SparcP07214 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SparcP07214 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SparcP07214 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SparcP07214 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SparcP07214 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SparcP07214 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SparcP07214 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SparcP07214 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SparcP07214 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SparcP07214 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SparcP07214 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SparcP07214 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SparcP07214 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SparcP07214 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SparcP07214 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SparcP07214 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SparcP07214 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SparcP07214 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SparcP07214 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SparcP07214 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SparcP07214 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SparcP07214 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SparcP07214 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SparcP07214 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SparcP07214 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SparcP07214 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SparcP07214 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SparcP07214 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SparcP07214 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SparcP07214 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SparcP07214 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SparcP07214 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SparcP07214 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SparcP07214 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SparcP07214 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SparcP07214 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SparcP07214 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SparcP07214 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SparcP07214 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SparcP07214 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SparcP07214 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SparcP07214 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SparcP07214 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SparcP07214 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SparcP07214 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SparcP07214 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SparcP07214 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SparcP07214 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SparcP07214 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SparcP07214 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SparcP07214 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SparcP07214 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SparcP07214 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SparcP07214 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms