Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04212 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04212 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04212 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04212 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04212 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04212 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04212 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P04212 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P04212 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04212 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04212 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04212 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04212 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04212 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04212 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04212 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04212 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04212 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04212 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04212 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04212 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04212 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04212 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04212 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04212 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04212 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04212 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04212 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04212 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04212 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04212 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04212 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04212 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04212 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P04212 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P04212 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04212 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04212 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04212 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04212 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04212 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04212 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04212 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04212 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04212 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04212 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04212 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04212 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04212 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P04212 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P04212 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04212 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04212 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04212 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04212 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04212 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04212 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04212 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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