Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ccl20O89093 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ccl20O89093 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ccl20O89093 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccl20O89093 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccl20O89093 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccl20O89093 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl20O89093 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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