Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apaf1O88879 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Apaf1O88879 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Apaf1O88879 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apaf1O88879 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apaf1O88879 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apaf1O88879 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apaf1O88879 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apaf1O88879 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Apaf1O88879 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apaf1O88879 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apaf1O88879 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apaf1O88879 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apaf1O88879 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apaf1O88879 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apaf1O88879 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apaf1O88879 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apaf1O88879 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apaf1O88879 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apaf1O88879 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apaf1O88879 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apaf1O88879 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apaf1O88879 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apaf1O88879 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apaf1O88879 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apaf1O88879 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apaf1O88879 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apaf1O88879 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apaf1O88879 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apaf1O88879 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apaf1O88879 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apaf1O88879 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apaf1O88879 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apaf1O88879 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apaf1O88879 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms