Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

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Length 779 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Hcn3O88705 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Hcn3O88705 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Hcn3O88705 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Hcn3O88705 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Hcn3O88705 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Hcn3O88705 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Hcn3O88705 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Hcn3O88705 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Hcn3O88705 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn3O88705 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Hcn3O88705 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcn3O88705 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcn3O88705 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcn3O88705 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcn3O88705 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcn3O88705 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcn3O88705 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcn3O88705 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcn3O88705 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcn3O88705 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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