Protein–RNA interactions for Protein: O88472

Tnfrsf17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf17O88472 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf17O88472 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms