Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnal1O88327 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ctnnal1O88327 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnal1O88327 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnal1O88327 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnal1O88327 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnal1O88327 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnal1O88327 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnal1O88327 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnal1O88327 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnal1O88327 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnal1O88327 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnal1O88327 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnal1O88327 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnal1O88327 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnal1O88327 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnal1O88327 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnal1O88327 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnal1O88327 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnal1O88327 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnal1O88327 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnal1O88327 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms