Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col5a1O88207 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms