Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top3aO70157 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3aO70157 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3aO70157 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3aO70157 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3aO70157 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3aO70157 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Top3aO70157 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Top3aO70157 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Top3aO70157 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Top3aO70157 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3aO70157 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3aO70157 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top3aO70157 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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