Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RngttO55236 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RngttO55236 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RngttO55236 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RngttO55236 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RngttO55236 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RngttO55236 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RngttO55236 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RngttO55236 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RngttO55236 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RngttO55236 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RngttO55236 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RngttO55236 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RngttO55236 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RngttO55236 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RngttO55236 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RngttO55236 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RngttO55236 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RngttO55236 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RngttO55236 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RngttO55236 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RngttO55236 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RngttO55236 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RngttO55236 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RngttO55236 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RngttO55236 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RngttO55236 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RngttO55236 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RngttO55236 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RngttO55236 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RngttO55236 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RngttO55236 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RngttO55236 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RngttO55236 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RngttO55236 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RngttO55236 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RngttO55236 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RngttO55236 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RngttO55236 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RngttO55236 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RngttO55236 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RngttO55236 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RngttO55236 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RngttO55236 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RngttO55236 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RngttO55236 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RngttO55236 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RngttO55236 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RngttO55236 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RngttO55236 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RngttO55236 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RngttO55236 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RngttO55236 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RngttO55236 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RngttO55236 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RngttO55236 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RngttO55236 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RngttO55236 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RngttO55236 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RngttO55236 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RngttO55236 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RngttO55236 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RngttO55236 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RngttO55236 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RngttO55236 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RngttO55236 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RngttO55236 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RngttO55236 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RngttO55236 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RngttO55236 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RngttO55236 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RngttO55236 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RngttO55236 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RngttO55236 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RngttO55236 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RngttO55236 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RngttO55236 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RngttO55236 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RngttO55236 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RngttO55236 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RngttO55236 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RngttO55236 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RngttO55236 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RngttO55236 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RngttO55236 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RngttO55236 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RngttO55236 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RngttO55236 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RngttO55236 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RngttO55236 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RngttO55236 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RngttO55236 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RngttO55236 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RngttO55236 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RngttO55236 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RngttO55236 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RngttO55236 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RngttO55236 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RngttO55236 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RngttO55236 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms