Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms