Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn20O55082 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms