Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CrxO54751 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CrxO54751 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CrxO54751 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CrxO54751 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CrxO54751 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CrxO54751 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CrxO54751 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CrxO54751 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CrxO54751 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CrxO54751 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
CrxO54751 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CrxO54751 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CrxO54751 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CrxO54751 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CrxO54751 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CrxO54751 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CrxO54751 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CrxO54751 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CrxO54751 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CrxO54751 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CrxO54751 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CrxO54751 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CrxO54751 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CrxO54751 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CrxO54751 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CrxO54751 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CrxO54751 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CrxO54751 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CrxO54751 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CrxO54751 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CrxO54751 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CrxO54751 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CrxO54751 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CrxO54751 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CrxO54751 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CrxO54751 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CrxO54751 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CrxO54751 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CrxO54751 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CrxO54751 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CrxO54751 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CrxO54751 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CrxO54751 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CrxO54751 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CrxO54751 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CrxO54751 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CrxO54751 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CrxO54751 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CrxO54751 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CrxO54751 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CrxO54751 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CrxO54751 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CrxO54751 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CrxO54751 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CrxO54751 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CrxO54751 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CrxO54751 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CrxO54751 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CrxO54751 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CrxO54751 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CrxO54751 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CrxO54751 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CrxO54751 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CrxO54751 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CrxO54751 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CrxO54751 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CrxO54751 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
CrxO54751 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
CrxO54751 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CrxO54751 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CrxO54751 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CrxO54751 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CrxO54751 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CrxO54751 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CrxO54751 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CrxO54751 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CrxO54751 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CrxO54751 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CrxO54751 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CrxO54751 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CrxO54751 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CrxO54751 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CrxO54751 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CrxO54751 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CrxO54751 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CrxO54751 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CrxO54751 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CrxO54751 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CrxO54751 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CrxO54751 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CrxO54751 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CrxO54751 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CrxO54751 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CrxO54751 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CrxO54751 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CrxO54751 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CrxO54751 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CrxO54751 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CrxO54751 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms