Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek2O35942 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek2O35942 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek2O35942 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek2O35942 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek2O35942 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek2O35942 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek2O35942 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms