Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5r2O35926 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 228.3 ms