Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk2O35491 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk2O35491 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clk2O35491 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clk2O35491 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clk2O35491 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms