Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc27a2O35488 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms