Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms