Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms