Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe40O35185 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms