Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcns1O35173 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms