Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ArxO35085 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ArxO35085 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ArxO35085 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ArxO35085 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ArxO35085 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ArxO35085 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ArxO35085 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ArxO35085 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ArxO35085 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ArxO35085 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ArxO35085 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ArxO35085 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ArxO35085 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ArxO35085 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ArxO35085 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ArxO35085 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ArxO35085 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ArxO35085 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ArxO35085 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ArxO35085 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ArxO35085 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ArxO35085 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ArxO35085 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ArxO35085 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ArxO35085 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ArxO35085 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ArxO35085 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ArxO35085 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ArxO35085 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ArxO35085 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ArxO35085 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ArxO35085 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ArxO35085 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ArxO35085 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ArxO35085 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ArxO35085 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ArxO35085 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ArxO35085 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ArxO35085 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ArxO35085 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ArxO35085 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ArxO35085 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ArxO35085 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ArxO35085 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ArxO35085 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ArxO35085 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ArxO35085 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ArxO35085 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ArxO35085 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ArxO35085 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ArxO35085 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ArxO35085 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ArxO35085 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ArxO35085 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ArxO35085 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ArxO35085 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ArxO35085 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ArxO35085 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ArxO35085 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ArxO35085 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ArxO35085 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ArxO35085 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ArxO35085 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ArxO35085 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ArxO35085 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ArxO35085 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ArxO35085 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ArxO35085 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ArxO35085 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ArxO35085 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ArxO35085 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ArxO35085 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ArxO35085 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ArxO35085 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ArxO35085 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ArxO35085 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ArxO35085 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ArxO35085 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ArxO35085 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ArxO35085 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ArxO35085 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ArxO35085 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ArxO35085 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ArxO35085 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ArxO35085 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ArxO35085 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ArxO35085 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ArxO35085 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ArxO35085 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ArxO35085 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ArxO35085 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ArxO35085 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ArxO35085 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ArxO35085 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ArxO35085 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ArxO35085 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ArxO35085 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ArxO35085 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ArxO35085 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms