Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Casq1O09165 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Casq1O09165 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Casq1O09165 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Casq1O09165 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Casq1O09165 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Casq1O09165 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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