Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl1O09117 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms