Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EllO08856 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EllO08856 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EllO08856 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EllO08856 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EllO08856 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EllO08856 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EllO08856 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EllO08856 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EllO08856 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EllO08856 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EllO08856 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EllO08856 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EllO08856 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EllO08856 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EllO08856 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EllO08856 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EllO08856 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EllO08856 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EllO08856 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EllO08856 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EllO08856 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EllO08856 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EllO08856 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EllO08856 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EllO08856 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EllO08856 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EllO08856 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EllO08856 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EllO08856 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EllO08856 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EllO08856 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EllO08856 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EllO08856 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EllO08856 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EllO08856 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EllO08856 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EllO08856 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EllO08856 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EllO08856 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EllO08856 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EllO08856 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EllO08856 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EllO08856 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EllO08856 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EllO08856 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EllO08856 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EllO08856 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EllO08856 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EllO08856 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EllO08856 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EllO08856 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EllO08856 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EllO08856 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EllO08856 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EllO08856 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EllO08856 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EllO08856 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EllO08856 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EllO08856 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EllO08856 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EllO08856 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EllO08856 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EllO08856 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EllO08856 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EllO08856 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EllO08856 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EllO08856 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EllO08856 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EllO08856 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EllO08856 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EllO08856 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EllO08856 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EllO08856 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EllO08856 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EllO08856 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EllO08856 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EllO08856 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EllO08856 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EllO08856 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EllO08856 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EllO08856 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EllO08856 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EllO08856 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EllO08856 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EllO08856 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EllO08856 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EllO08856 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EllO08856 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EllO08856 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EllO08856 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EllO08856 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EllO08856 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EllO08856 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EllO08856 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EllO08856 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EllO08856 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EllO08856 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EllO08856 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EllO08856 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms