Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra2O08842 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms